Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3484989	3486747	1759	100 [0]	[0] 52	[ppc]–[yijP]	[ppc],[yijP]

ACCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAT  >  W3110S.gb/3484920‑3484988                                                                     | aCCAAGCGTCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1330150/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCTAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1371465/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCTAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:95629/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCTAGGCTCCAt  <  1:1245662/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:51443/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:691939/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:686611/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:667312/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:665589/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:639485/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:599100/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:571055/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:536519/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:530801/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:522120/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:707171/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:511895/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:501426/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:493703/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:475231/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:459701/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:452086/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:429402/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:407523/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:406730/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:374505/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:365595/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:834402/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:99091/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:959072/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:938435/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:930612/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:924188/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:920880/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:914692/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:904501/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:870391/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:868226/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:857768/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:36277/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:829851/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:828568/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:813194/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:812101/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:784647/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:767131/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:755628/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:749951/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:730384/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:725003/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1189689/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1348633/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1059662/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1324211/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1322458/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1315792/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1263616/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1244834/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:124120/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1221656/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1195856/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:119343/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1324794/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1173890/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1161409/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1158583/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1155558/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1153214/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1131029/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1130141/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1126137/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1101840/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1085519/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1060943/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1372415/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:322568/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:285028/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:241227/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:236644/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:232741/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:230910/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:227845/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:22377/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:185515/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1547462/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1447483/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1446240/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1404678/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1383769/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1369985/69‑1 (MQ=255) aCCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGCCTCCAt  <  1:206933/69‑1 (MQ=255)  ccAAGCGCCGAAACGCTCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1374480/68‑1 (MQ=255)  ccAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:185874/68‑1 (MQ=255)  ccAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:458572/68‑1 (MQ=255)  ccAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:749629/68‑1 (MQ=255)        gcCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:513993/62‑1 (MQ=255)          cGAACCGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:124044/60‑1 (MQ=255)              aCGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:219792/56‑1 (MQ=255)                               tACCTGCCAGGTGATTGGCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1314799/39‑1 (MQ=255)                                   tGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAt  <  1:1457224/35‑1 (MQ=255)                                                                     | ACCAAGCGCCGAAACGCGCGAAGTGCTCGATACCTGCCAGGTGATTGCCGAAGCACCGCAAGGCTCCAT  >  W3110S.gb/3484920‑3484988

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑