Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3537203 3537359 157 231 [0] [0] 17 rhaR DNA‑binding transcriptional activator, L‑rhamnose‑binding

Only 100 of 231 total aligned reads displayed.

TTGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGAA  >  W3110S.gb/3537136‑3537202
                                                                  |
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGTCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1411764/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:400639/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:603258/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:594912/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:561124/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:5569/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:531115/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:503852/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:481477/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:458263/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:448578/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:41079/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:632696/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:39214/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:376333/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:368370/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:360601/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:317426/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1012340/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:302807/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:298653/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:292664/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:271916/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:83978/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:985668/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:978999/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:934526/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:930028/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:91798/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:901007/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:894934/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:884223/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:873521/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:843249/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:305246/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:821390/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:799811/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:775836/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:758830/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:746337/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:737111/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:72543/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:717137/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:709594/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:680226/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1172458/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1439956/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1383632/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1376003/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1370695/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1346727/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1316338/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1304408/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1287617/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:127900/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1209229/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:233790/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1160579/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:113412/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1101574/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:108211/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:106446/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1048190/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1039090/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1030055/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1019303/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:178631/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1555403/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1546923/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1541531/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1538676/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1531496/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1593206/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1519730/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1604291/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:170871/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1517711/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1507782/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1486835/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1481148/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:208429/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:215423/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1449152/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCCaa  <  1:685404/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGGCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1109598/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATTGTCCCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:643907/67‑1 (MQ=255)
ttGTGTGGTGATTATCGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:548156/67‑1 (MQ=255)
ttGCGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:256400/67‑1 (MQ=255)
tggtgtgGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:129078/65‑1 (MQ=255)
 tgtgtgGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATTGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:941953/66‑1 (MQ=255)
 tgtgtgGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:454611/66‑1 (MQ=255)
 tgtgtgGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:973635/66‑1 (MQ=255)
     tggtgATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1341317/62‑1 (MQ=255)
       gtgATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:371876/60‑1 (MQ=255)
            tattGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:937465/55‑1 (MQ=255)
                gTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:96164/51‑1 (MQ=255)
                     cgcTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:718130/46‑1 (MQ=255)
                      gcTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:573159/45‑1 (MQ=255)
                      gcTAACAGCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1417792/45‑1 (MQ=255)
                       cTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGaa  <  1:1197381/44‑1 (MQ=255)
                                                                  |
TTGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTTCTGCGAA  >  W3110S.gb/3537136‑3537202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑