Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	302269	302546	278	94 [0]	[0] 35	yagU	conserved inner membrane protein

ACAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGCA  >  W3110S.gb/302200‑302268                                                                     | aCAAGCAGTGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:352480/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGCCGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:445334/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:640584/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:645466/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:617495/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:614411/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:592124/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:58146/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:529736/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:519828/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:507923/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:495342/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:480553/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:469736/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:414674/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:349587/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:347749/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:344983/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:333881/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:324787/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:289258/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:278057/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1002528/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:839276/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:987105/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:971704/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:971624/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:961865/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:953462/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:936950/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:927358/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:919956/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:906549/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:891997/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:875121/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:273264/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:82950/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:826052/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:817178/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:772284/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:733189/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:716800/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:711284/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:689975/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:680808/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:672706/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1116242/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1301381/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:270001/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1298710/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1280520/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1264727/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1249344/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1219472/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1215864/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1181426/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1169966/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1137149/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1300291/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1106881/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1077625/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:107405/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1065686/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1064230/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:10520/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:104988/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1048054/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1022446/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1013263/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1502904/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:268169/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:239782/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:236091/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:163964/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1576475/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1563253/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:153070/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1525804/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1524136/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1503942/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1455922/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:145204/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1405356/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1373144/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1371373/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1355023/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1325287/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1306185/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1303910/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGTAGATATGAATATATATGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1071988/69‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGGGAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:748550/69‑1 (MQ=255)     gCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:1259037/65‑1 (MQ=255)            aGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGACCCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:180564/58‑1 (MQ=255)                  gAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGca  <  1:62147/52‑1 (MQ=255)                                                                     | ACAAGCAGGGTAGATATGAATATATTTGAACAAACTCCACCGAACCGCAGACGTTATGGTCTTGCTGCA  >  W3110S.gb/302200‑302268

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑