Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3730342	3730531	190	40 [0]	[0] 133	bglG	transcriptional antiterminator of the bgl operon

CAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCT  >  W3110S.gb/3730274‑3730341                                                                    | cAGTCATGAACTGAACGGGCTATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:810689/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGCACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1594261/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:420941/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:262165/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:272110/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:273415/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:348452/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:369436/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:379386/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:391517/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:398322/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:245727/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:448362/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:462278/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:50525/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:516612/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:676751/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:735438/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:817708/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:985374/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1273800/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1022725/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1036570/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1052741/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1074584/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1214066/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1214198/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1225157/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1001094/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1296251/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1324593/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1429362/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1479303/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1489796/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1531171/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:169529/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:20802/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCATGAGGTGATGGCAACCt  >  1:807126/1‑68 (MQ=255) cAGTCATGAACTGAAAGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:1108745/1‑68 (MQ=255) cAGTCAAGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCt  >  1:207925/1‑68 (MQ=255)                                                                    | CAGTCATGAACTGAACGGGCGATTAAGCGAACTCTTAAGTCATATTCCTCTTGAGGTGATGGCAACCT  >  W3110S.gb/3730274‑3730341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑