Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3735286	3735381	96	34 [0]	[0] 47	bglH	carbohydrate‑specific outer membrane porin, cryptic

CCGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTCGCG  >  W3110S.gb/3735217‑3735285                                                                     | ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1111009/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:981920/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:759180/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:753530/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:713421/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:652851/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:496422/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:490292/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:402117/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:396847/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:318047/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:220062/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:183672/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:168389/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1565925/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1245482/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1029582/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1126417/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1142454/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1143749/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1143926/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1189941/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1237369/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1564656/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1248807/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1285622/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1375150/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1484849/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:1530174/69‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:154989/69‑1 (MQ=255)  cGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:468894/68‑1 (MQ=255)  cGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:303611/68‑1 (MQ=255)  cGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:165819/68‑1 (MQ=255)         ggTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTcgcg  <  1:878608/61‑1 (MQ=255)                                                                     | CCGCAGCGGGTGTAGGTCTGGAAAACTGGAAAGTCGGTCCGGGTAAAATTGATATCGCGCTGGTTCGCG  >  W3110S.gb/3735217‑3735285

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑