Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3797495	3797613	119	75 [0]	[0] 124	yicO	predicted xanthine/uracil permase

TGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTC  >  W3110S.gb/3797428‑3797494                                                                   | tgtttCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:340376/64‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:357036/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:482008/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:423605/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:421669/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:417451/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:378356/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:369011/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:364/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:363397/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:357709/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:49185/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:333932/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:330096/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:323719/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:298421/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:287366/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:267314/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:262792/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:657848/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:858768/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:848612/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:825174/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:754589/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:737109/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:685132/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:676454/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:668002/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1046100/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:652370/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:607201/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:589958/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:582120/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:581572/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:550368/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:524172/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:510597/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1137940/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1317039/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1289277/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1270906/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1234933/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:122971/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1206377/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1157050/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1156916/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:195456/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1118425/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1117390/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1105753/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1104922/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1074064/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1065538/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1064146/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1033307/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1484464/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:188256/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:183776/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:161471/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1581094/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1575395/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:233984/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1486829/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1319151/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1451508/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1432128/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1431849/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:139835/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1345728/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1344536/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1336332/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1326003/67‑1 (MQ=255) tGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGAAAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:875037/67‑1 (MQ=255)  gATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTc  <  1:1487630/66‑1 (MQ=255)                              cTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGGAACGGTAAATTc  <  1:1126782/38‑1 (MQ=255)                                                                   | TGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTC  >  W3110S.gb/3797428‑3797494

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑