Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3802316	3802433	118	38 [0]	[10] 140	setC	predicted sugar efflux system

TCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGC  >  W3110S.gb/3802260‑3802315                                                        | tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCTAATCATCGc  <  1:1488340/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:721187/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:338164/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:410972/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:469904/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:52301/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:575375/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:636427/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:673117/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:715097/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:309751/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:724519/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:74754/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:757197/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:794670/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:795607/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:910684/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:912538/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:950303/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1338225/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1054897/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1109015/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1121610/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1187801/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1228974/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1228986/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1239036/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1297914/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1320929/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1018642/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1381238/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1422509/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1513500/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1527262/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:1554442/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:255606/56‑1 (MQ=255) tCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:269397/56‑1 (MQ=255)  cTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTATTAAACAGCAGGCAAATCATCGc  <  1:323601/55‑1 (MQ=255)                                                        | TCTTAGCCCAGACTGGTGAGCTAAATATCTTTAATAAACAGCAGGCAAATCATCGC  >  W3110S.gb/3802260‑3802315

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑