Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3834739	3835039	301	26 [0]	[1] 30	rfaP	kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide

GATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAC  >  W3110S.gb/3834670‑3834738                                                                     | gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:272001/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:711152/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:635517/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:602925/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:582308/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:502195/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:385347/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:376070/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:345703/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1165885/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:152837/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1503139/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1468653/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1459195/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1448353/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1385028/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1323910/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1304562/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1301560/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1280516/69‑1 (MQ=255) gATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:1183246/69‑1 (MQ=255)  aTGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:336928/68‑1 (MQ=255)  aTGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:497406/68‑1 (MQ=255)  aTGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:502019/68‑1 (MQ=255)                  cagacagaGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:229394/52‑1 (MQ=255)                   agacagaGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAc  <  1:464337/51‑1 (MQ=255)                                                                     | GATGCCCGTTTTGGGCGCAGACAGAGAGTGGCACGCTATTCATCGCCTGAGTGATGTTGGCGTTGATAC  >  W3110S.gb/3834670‑3834738

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑