Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3843631	3843773	143	62 [0]	[0] 266	rfaC	ADP‑heptose:LPS heptosyl transferase I

TCTTCCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTG  >  W3110S.gb/3843562‑3843630                                                                     | tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:699067/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1007476/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:310413/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:410859/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:423664/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:432081/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:441451/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:457882/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:462698/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:464805/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:490967/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:529277/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:590624/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:624512/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:674119/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:674925/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:285115/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:706621/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:708038/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:714913/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:724511/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:739482/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:74065/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:764249/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:780589/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:810460/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:838593/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:871761/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:910693/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:92386/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:972202/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1492253/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1031516/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1039565/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:112054/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1147815/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:119454/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1242667/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1277726/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1314630/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:139022/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1390460/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1409804/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1427683/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1475412/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1487412/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:280155/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1495729/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:150205/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1513511/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1528109/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1547641/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1559410/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:156493/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1566363/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1570538/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1575739/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:1577462/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:19073/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:223041/1‑69 (MQ=255) tcttcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:245125/1‑69 (MQ=255) tattcCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTg  >  1:711684/3‑69 (MQ=255)                                                                     | TCTTCCCATACCCACCAATTAATCCCGGATCGGTTGGTCCATAAACCGTGATATTGGGTCTATCCAGTG  >  W3110S.gb/3843562‑3843630

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑