Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3844645	3844691	47	42 [0]	[0] 124	rfaF	ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II

TCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCG  >  W3110S.gb/3844576‑3844644                                                                     | tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGCCCATACAGGGCACCCAGCg  >  1:1028457/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCACCCAGCg  >  1:391243/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCcgcg  >  1:262713/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCcgcg  >  1:1392386/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:81409/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:605288/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:642533/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:671129/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:72295/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:728036/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:74433/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:762770/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:789375/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:80862/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:468490/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:81674/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:833419/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:907732/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:9103/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:925944/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:927192/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:952990/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:970382/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1445402/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1132943/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1149888/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1187371/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1225748/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1269184/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1309704/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1312286/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1353562/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1409742/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:58967/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1514588/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:232494/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:24997/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:272143/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:284552/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:348979/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1025284/1‑69 (MQ=255) tCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCg  >  1:1071706/1‑69 (MQ=255)                                                                     | TCACGCGCGCTTTATGGGATAGCGGCGGTGTGAAGTCCGGGCTACTCGGACCATACAGGGCAACCAGCG  >  W3110S.gb/3844576‑3844644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑