Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3861837	3861839	3	53 [0]	[1] 181	lldP	L‑lactate permease

CCGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAT  >  W3110S.gb/3861781‑3861836                                                        | ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:680062/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:318407/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:32163/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:328110/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:33959/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:345234/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:434231/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:44558/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:481040/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:594927/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:595103/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:606026/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:636220/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1037356/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:696835/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:698274/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:714402/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:748374/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:820496/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:827761/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:839360/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:84207/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:85664/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:912217/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:965027/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1429559/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1054623/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1173688/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1178682/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1247157/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:126500/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1311122/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1322501/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:135189/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1435266/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1485849/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:154960/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:186982/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:239845/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:262115/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:273832/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:275827/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:279003/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:279636/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:285165/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:312685/56‑1 (MQ=255) ccGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTACCGAAGGTGCTGAt  <  1:691834/56‑1 (MQ=255)  cGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:683889/55‑1 (MQ=255)  cGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1000585/55‑1 (MQ=255)       gAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1122037/50‑1 (MQ=255)           aGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:287073/46‑1 (MQ=255)                   agagCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:1254663/38‑1 (MQ=255)                    gagCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAt  <  1:987741/37‑1 (MQ=255)                                                        | CCGATGGAGTAGATGGGCAGAGCCAGTTCTTTCAGCGTGCTGCCGAAGGTGCTGAT  >  W3110S.gb/3861781‑3861836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑