Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3868300	3868446	147	44 [0]	[0] 75	mtlA/yibI	fused mannitol‑specific PTS enzyme IIABC components/predicted inner membrane protein

GCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATAAA  >  W3110S.gb/3868232‑3868299                                                                    | gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCCCATaaa  <  1:206900/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:733062/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:462069/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:533329/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:536284/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:538091/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:613190/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:614180/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:621186/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:637778/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:643809/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:683907/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:404667/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:743362/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:770609/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:784784/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:845887/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:853366/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:85694/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:932279/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:977392/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:978924/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:979942/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1594484/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1069144/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1164145/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1178788/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:123593/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1265515/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:135534/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1419212/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1010984/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:165458/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:218542/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:222829/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:223111/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:230505/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:264864/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:297590/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:328792/68‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:356417/68‑1 (MQ=255)  cGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1498110/67‑1 (MQ=255)                 aaTCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1109653/52‑1 (MQ=255)                      gTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATaaa  <  1:1371332/47‑1 (MQ=255)                                                                    | GCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATCACATAAA  >  W3110S.gb/3868232‑3868299

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑