Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3872941 3872946 6 163 [0] [0] 84 yibJ predicted Rhs‑family protein

Only 100 of 163 total aligned reads displayed.

ATACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGT  >  W3110S.gb/3872873‑3872940
                                                                   |
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCTGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:720341/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:376549/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:556281/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:488603/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:485074/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:461239/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:448265/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:447130/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:43235/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:425544/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:410564/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:379300/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:601431/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:365038/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:337760/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:313542/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:290168/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:283081/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:271397/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:265065/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:260529/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:259549/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:247024/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:778714/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:968100/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:950414/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:913724/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:884969/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:868206/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:85251/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:848294/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:834195/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:824369/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:807354/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:58919/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:773030/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:771351/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:750711/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:72148/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:690072/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:683237/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:661524/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:649529/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:642419/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1039738/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1180021/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1363201/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1344565/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1325815/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1282014/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1281454/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1019055/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1271599/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1245982/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1239185/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1202310/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1181116/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1345374/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1174705/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1167573/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:116501/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1155831/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:112961/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1103113/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1093785/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1092680/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1088521/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1067675/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1516695/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:221899/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:18686/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:183317/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1668/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1601700/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1594515/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1549002/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1538472/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1531888/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1516711/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1385102/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1513366/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1488738/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1478316/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1452754/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1438921/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1423733/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1414033/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:140124/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCCGCAGATGATGCGGGt  <  1:738316/68‑1 (MQ=255)
aTACAGGCCGGACCCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:545166/68‑1 (MQ=255)
 tACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:349967/67‑1 (MQ=255)
   cAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:557538/65‑1 (MQ=255)
        cGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:965061/60‑1 (MQ=255)
              cctcATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:270989/54‑1 (MQ=255)
                       aCTGCTGACCCGGCTGGCGAATGTGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1337716/45‑1 (MQ=38)
                        ctgctgACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:975101/44‑1 (MQ=255)
                         tgctgACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:696620/43‑1 (MQ=255)
                         tgctgACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:677125/43‑1 (MQ=255)
                             gACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:223913/39‑1 (MQ=255)
                               cccGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGt  <  1:1066747/37‑1 (MQ=255)
                                                                   |
ATACAGGCCGGACTCCTCATCATACTGCTGACCCGGCAGGCGAATGAGCTGCTGCAGATGATGCGGGT  >  W3110S.gb/3872873‑3872940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑