Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3898916	3898963	48	41 [0]	[0] 105	yiaI	predicted hydrogenase, 4Fe‑4S ferredoxin‑type component

TTATTGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGCATCAT  >  W3110S.gb/3898848‑3898915                                                                    | ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGTAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:953893/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:715515/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:253037/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:483223/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:503034/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:578643/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:599305/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:602509/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:615770/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:623026/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:634880/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1029665/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:771178/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:822986/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:843621/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:857943/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:906971/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:907588/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:950755/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:981608/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:141373/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1029387/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1031823/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:103433/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1306290/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1329505/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1336505/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1338216/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1429872/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1454570/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1505334/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1513031/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1528234/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1560114/68‑1 (MQ=255) ttattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1587444/68‑1 (MQ=255)  tattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1425687/67‑1 (MQ=255)  tattGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1376392/67‑1 (MQ=255)             cgacgaAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:7456/56‑1 (MQ=255)              gacgaAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1583940/55‑1 (MQ=255)                    aTGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:1404782/49‑1 (MQ=255)                             ttGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGcatcat  <  1:240472/40‑1 (MQ=255)                                                                    | TTATTGCGGATGCGACGAAATGTATCGGTTGCCGTACCTGTGAAGTGGCTTGCGCAGTGTCGCATCAT  >  W3110S.gb/3898848‑3898915

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑