Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3899089	3899417	329	89 [0]	[0] 135	[yiaI]	[yiaI]

GATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGA  >  W3110S.gb/3899021‑3899088                                                                    | gATTCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1368132/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCTATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:636494/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGCTAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:608439/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGTATATTTTCGTTGa  <  1:1036644/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:38638/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:521210/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:52051/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:519162/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:508194/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:503140/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:478247/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:45386/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:416026/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:411643/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:561054/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:383224/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:380052/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:335995/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:329297/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:325580/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:301765/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:286413/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:266794/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:259359/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:217635/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:697981/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:95714/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:941468/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:927531/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:880610/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:876797/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:855194/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:786458/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:765194/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:724695/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:539703/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:694740/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:67824/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:64849/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:638789/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:616749/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:613863/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:606968/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:585971/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:201361/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1182825/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1410690/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:210851/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1343620/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1343289/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1290836/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1242842/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:12237/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1220771/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1195526/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1194840/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1360482/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1157806/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1147291/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1121180/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1113885/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1080178/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1045023/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1034125/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1017143/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1004855/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1475839/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1002191/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:195240/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:172252/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:165652/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:15708/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1569078/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1553073/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1490191/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1487711/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1483792/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1414010/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1474299/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1460728/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1459272/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1457831/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1455354/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1455171/68‑1 (MQ=255) gATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1449281/68‑1 (MQ=255)    gCACCGTGCGCGAATGGCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGGTGa  <  1:1286175/65‑1 (MQ=255)                     cTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1287995/48‑1 (MQ=255)                        cccTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:1484307/45‑1 (MQ=255)                        cccTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGa  <  1:614907/45‑1 (MQ=255)                                                                    | GATGCACCGTGCGCGAATGTCTGCCCTGTTGACGCGATAAGCCGCGAACATGGGCATATTTTCGTTGA  >  W3110S.gb/3899021‑3899088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑