Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3900430 3901284 855 164 [0] [1] 170 [avtA]–[malS] [avtA],[malS]

Only 100 of 164 total aligned reads displayed.

CAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGA  >  W3110S.gb/3900361‑3900429
                                                                    |
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACTCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:384766/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTTTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:659914/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTTGTTCGa  <  1:2603/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:419023/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:608072/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:596849/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:641122/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:562376/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:530397/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:52559/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:524849/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:513247/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:451039/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:441829/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:291898/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:402961/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:287640/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:369061/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:365337/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:361432/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:350866/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:344756/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:325423/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:316095/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:295563/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:846689/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:981179/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:980764/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:958567/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:956059/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:951400/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:921014/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:909611/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:895643/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:881212/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:867304/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:862775/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:635643/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:807677/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:805939/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:794194/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:789633/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:781026/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:762720/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:710445/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:693119/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:660384/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:647309/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1026716/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1199007/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1368697/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1363401/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1353648/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1328236/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1322091/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1289416/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1275170/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1252659/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1240645/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1216767/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:239020/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:118405/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1124723/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1080599/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1078960/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1073463/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1070621/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1051833/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1041213/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1040097/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1003443/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:15595/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:197992/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:20142/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:164014/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:161209/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1392606/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1585121/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:206768/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:207888/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1490647/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1464857/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1457333/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1427790/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1404561/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGGTCGa  <  1:1596615/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGAGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:255509/69‑1 (MQ=255)
cAAACAGGCTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1295718/69‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:313480/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:813430/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1068618/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:909421/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:185530/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:18267/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1202932/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1238093/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1513434/68‑1 (MQ=255)
 aaaCAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGGTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:154537/68‑1 (MQ=255)
                   gAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:982551/50‑1 (MQ=255)
                               ctGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGa  <  1:1305523/38‑1 (MQ=255)
                                                                    |
CAAACAGGTTAAATAAGTAGAAAAACGCGCTCTGGCTGCCGTTTGTTAGTGCAATATTCTGTGGTTCGA  >  W3110S.gb/3900361‑3900429

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑