Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3925478	3925727	250	83 [0]	[0] 40	bisC	biotin sulfoxide reductase

ACTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAT  >  W3110S.gb/3925436‑3925477                                          | aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:42728/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:629819/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:617264/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:609991/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:609397/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:596145/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:595095/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:538553/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:529809/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:453998/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:429158/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:637171/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:420290/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:400073/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:397657/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:341912/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:337671/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:323057/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:295962/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:25257/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:251891/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:796421/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:988470/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:900064/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:870134/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:869581/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:867717/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:862204/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:850030/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:848743/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:832710/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:214620/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:794576/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:788596/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:768591/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:735244/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:699339/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:694712/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:671031/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:664207/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:646853/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1189918/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1006158/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1308865/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1286562/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:127764/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1266964/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1248906/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1245552/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1226322/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1222141/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1218775/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1310475/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1167450/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1139124/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:113481/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1082545/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1061218/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1053973/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:104340/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1024108/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1010600/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1500906/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:211475/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:188057/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:185494/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:165399/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1587645/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1571204/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1533233/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1523515/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1507133/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1311825/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1467844/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1462691/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:146016/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:145048/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1442995/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  <  1:1417767/42‑1 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:141547/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1377185/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAt  >  1:1349298/1‑42 (MQ=255) aCTACCTCTTATGAGCGTAATGATCTCACCATGACCCGTGAt  >  1:894588/1‑42 (MQ=38)                                          | ACTACCTCTTTTGAGCGTAATGATCTCACCATGACCGGTGAT  >  W3110S.gb/3925436‑3925477

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑