Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3955846	3956070	225	44 [0]	[0] 148	yhjK	predicted diguanylate cyclase

GGTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTG  >  W3110S.gb/3955777‑3955845                                                                     | ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:615066/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:332320/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:362652/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:373800/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:392292/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:434914/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:440125/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:50540/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:52446/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:589774/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:603545/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:297035/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:642878/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:668181/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:699967/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:701825/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:753130/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:806385/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:831234/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:854875/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:922963/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:942518/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1515892/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1067389/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1092163/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1135054/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1142153/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1194761/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1197541/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1239047/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1276824/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1342647/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1509273/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1014159/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1518729/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1533577/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1554134/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1560445/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:1601314/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:207853/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:223133/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:256229/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:281225/69‑1 (MQ=255) ggTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTg  <  1:287820/69‑1 (MQ=255)                                                                     | GGTGTACAGGAACCGTGGCACGCAATCACCTTAGGTCAGCAAGTGCTCACTATCATGAGCGAGCGCCTG  >  W3110S.gb/3955777‑3955845

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑