Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3956938	3956941	4	36 [0]	[0] 75	yhjK/dctA	predicted diguanylate cyclase/C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter

ATGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCTT  >  W3110S.gb/3956870‑3956937                                                                    | aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCATGTACCCCATAACCtt  <  1:1080342/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:812891/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:35561/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:364670/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:460448/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:465388/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:603174/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:616229/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:745839/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:747321/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:758873/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:314882/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:827304/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:874950/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:881693/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:94116/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:955977/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:971921/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:972357/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1336430/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1022852/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1043869/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1123157/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1213977/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1226678/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1321440/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1330818/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1001586/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1348810/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1438310/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1452035/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:154559/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:195684/68‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:235683/68‑1 (MQ=255)  tGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1490270/67‑1 (MQ=255)                                  gtgtTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCtt  <  1:1053218/35‑1 (MQ=255)                                                                    | ATGATCCAGGTACATTTCTGTGATGTTGTCTGGGTGTTATTTTAAGGCCGCAGGTACCCCATAACCTT  >  W3110S.gb/3956870‑3956937

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑