Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3968802	3969497	696	54 [0]	[0] 199	[yhjB]–[treF]	[yhjB],[treF]

CAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATC  >  W3110S.gb/3968733‑3968801                                                                     | ccaTTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1439232/67‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACTGGAAGTTATc  <  1:1517565/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGTAAGTTATc  <  1:759781/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:629619/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:219694/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:237619/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:238578/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:264800/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:367356/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:471299/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:486593/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:491562/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:529991/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:598990/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:615376/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1056533/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:645426/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:675760/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:7089/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:734495/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:78060/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:78852/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:795016/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:831027/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:837400/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:840858/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:877773/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:214992/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1063269/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1077982/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1097571/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1167914/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1168933/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1173221/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1213798/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1245503/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1267090/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1294679/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:105078/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1328095/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1352632/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1394445/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1403106/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1463091/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1472365/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1487523/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1493726/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:151247/69‑1 (MQ=255) cAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:209385/69‑1 (MQ=255)   aTTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGTAAGTTATc  <  1:877399/67‑1 (MQ=255)       ccTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:1150220/63‑1 (MQ=255)             gTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:211864/57‑1 (MQ=255)                       tAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:929150/47‑1 (MQ=255)                            aCGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATc  <  1:63774/42‑1 (MQ=255)                                                                     | CAATTTCCTGAGGTTAAGGTGTTAATTACGGCGACGGATTGCAATAAACGGTGGTTACAGGAAGTTATC  >  W3110S.gb/3968733‑3968801

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑