Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3981539 3981983 445 158 [0] [8] 11 gadE DNA‑binding transcriptional activator

Only 100 of 158 total aligned reads displayed.

AGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGT  >  W3110S.gb/3981470‑3981538
                                                                    |
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:35874/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:520557/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:51943/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:50438/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:475462/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:468347/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:462863/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:447943/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:407344/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:405508/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:378120/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:372695/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:362804/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:543374/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:338142/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:307741/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:294820/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:286866/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:260960/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:251237/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:206963/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:201429/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:193539/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1013287/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:182075/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:772339/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:985688/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:959888/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:937277/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:881414/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:878329/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:848724/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:839619/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:815503/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:815447/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:812255/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:795815/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:186380/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:752771/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:729196/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:684881/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:671374/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:650155/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:632873/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:623257/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:592695/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:591985/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:563082/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:546832/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1155482/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1355766/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:169177/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1342925/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1315281/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1294336/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1279489/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1237371/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1185185/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:11731/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1170758/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1169712/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1346060/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1133656/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1104340/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1097315/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:108843/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1074748/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1066487/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1059232/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1049777/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1048959/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:103213/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1015100/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1489323/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:167237/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1603239/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1586529/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1577362/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1567450/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1532734/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:153191/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:151180/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1359210/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1470099/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1448912/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1443026/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1428502/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1409918/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1396708/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1379312/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1374065/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1366816/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCAGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:615925/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGACCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1503745/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTCATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1514159/69‑1 (MQ=255)
aGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGCTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1406687/69‑1 (MQ=255)
    tCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:1029443/65‑1 (MQ=255)
       gCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:61256/62‑1 (MQ=255)
                       cagccaTCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:159505/46‑1 (MQ=255)
                          ccaTCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGAtgt  <  1:864133/43‑1 (MQ=255)
                                                                    |
AGCATCTGCATCCCTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGT  >  W3110S.gb/3981470‑3981538

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑