Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4002412	4002439	28	30 [0]	[0] 150	pitA	phosphate transporter, low‑affinity

CCACCACTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAT  >  W3110S.gb/4002343‑4002411                                                                     | ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCACCGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1551949/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:33092/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:998869/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:930483/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:923957/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:730416/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:729175/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:710385/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:696950/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:59784/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:548932/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:464980/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:430828/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:353133/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1041957/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:265135/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:262345/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:177854/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1506722/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1479885/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1367353/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1353346/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1252085/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1061060/69‑1 (MQ=255) ccaccaCTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGGTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:125934/69‑1 (MQ=255)  caccacTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1423847/68‑1 (MQ=255)  caccacTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:816281/68‑1 (MQ=255)       cTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:971689/63‑1 (MQ=255)                           gCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:314983/43‑1 (MQ=255)                               tGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAt  <  1:1559489/39‑1 (MQ=255)                                                                     | CCACCACTGACGTCCCGGTCATCAACGCATTGGTTAAACCAATCCCGATGATCGCGCCAATCAGCGTAT  >  W3110S.gb/4002343‑4002411

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑