Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4007465 4007478 14 206 [0] [0] 52 yhiK ECK3474:JW5674:b3489; hypothetical protein

Only 100 of 206 total aligned reads displayed.

GAAGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAT  >  W3110S.gb/4007395‑4007464
                                                                     |
gAAGACCCCAGCAAATACATTAGAC‑AAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:305801/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCGGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:406728/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGGTCATAATCAACAAt  <  1:1162597/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:632518/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:650571/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:614517/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:595242/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:554261/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:550239/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:512223/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:494692/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:481255/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:456018/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:402030/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:397570/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:387836/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:362575/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:329170/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:299098/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:291793/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:285284/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:233518/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:228382/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:100352/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:191454/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:832531/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:975855/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:970839/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:946422/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:944056/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:931599/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:904229/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:894663/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:886699/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:869253/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:865925/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:845398/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:211571/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:819870/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:801714/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:784854/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:764288/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:744380/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:737174/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:723862/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:701414/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:697642/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:665646/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1206020/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1385877/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:137764/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:17435/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1318489/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1302992/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1299456/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:126935/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1264731/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1241927/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1233641/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1340623/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1171179/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1164404/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1159253/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1157457/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1082568/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1061677/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1048534/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1040459/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1025631/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1005968/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1526521/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:168892/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:161850/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1600188/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1595524/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1587015/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1557467/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1542990/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1532975/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1524017/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1515585/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:140454/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1477987/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1425918/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1441139/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1508848/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1454613/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATAAACAAt  <  1:57601/69‑1 (MQ=255)
  aGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1575516/68‑1 (MQ=255)
  aGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1060910/68‑1 (MQ=255)
  aGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:371753/68‑1 (MQ=255)
  aGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1259066/68‑1 (MQ=255)
   gACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1177668/67‑1 (MQ=255)
      cccAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1102441/64‑1 (MQ=255)
         aGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1400000/61‑1 (MQ=255)
           cAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:234083/59‑1 (MQ=255)
            aaaTACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCATCAAt  <  1:1328183/58‑1 (MQ=255)
            aaaTACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:439707/58‑1 (MQ=255)
            aaaTACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:673495/58‑1 (MQ=255)
                     aGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1149763/49‑1 (MQ=255)
                                                                     |
GAAGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAT  >  W3110S.gb/4007395‑4007464

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑