Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4007854	4008441	588	85 [0]	[0] 104	yhiJ	hypothetical protein

GTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACT  >  W3110S.gb/4007785‑4007853                                                                     | gTTAACTATGTTTTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:55665/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:499428/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:661391/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:644993/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:643893/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:612510/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:591954/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:566045/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:564102/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:525597/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:518815/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:662905/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:470238/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:464049/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:454111/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:378687/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:369366/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:364311/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:356001/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:35452/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:347804/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:863896/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:996744/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:983134/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:931086/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:913288/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:902256/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:888321/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:878461/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:867382/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:864027/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1006648/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:844152/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:841128/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:788338/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:786971/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:762145/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:721320/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:69356/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:690679/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:673442/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1098416/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1416437/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:341640/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1397354/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1294826/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1271132/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:127046/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1248788/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1174764/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1170154/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1108373/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1401124/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1085562/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1080684/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1067068/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1058011/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1054562/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1045044/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1023343/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1013702/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1000645/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:147556/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1486727/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:280478/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1507291/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1527815/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1548933/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1560877/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:277731/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1580703/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:268075/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:250551/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1591640/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:174527/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:231468/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATAAGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:497045/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGCAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:303365/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATCAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:344100/69‑1 (MQ=255) gTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAAAAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1167036/69‑1 (MQ=255)  ttAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:639399/68‑1 (MQ=255)  ttAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1030375/68‑1 (MQ=255)    aaCTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1361342/66‑1 (MQ=255)             ttCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:1567999/57‑1 (MQ=255)                              tatGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACt  <  1:240686/40‑1 (MQ=255)                                                                     | GTTAACTATGTATTCCTCGCGGTAAATAATATGAGGTAAAATATGAAAATTGGAACTGTGGCAGGCACT  >  W3110S.gb/4007785‑4007853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑