Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4044039	4044129	91	53 [0]	[0] 93	livH	leucine/isoleucine/valine transporter subunit

CCACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCT  >  W3110S.gb/4043972‑4044038                                                                   | ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTTTGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:563576/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:639073/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:270661/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:327787/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:33758/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:35934/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:433596/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:443916/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:486335/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:496597/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:562942/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:581677/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:627373/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:231024/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:653696/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:653800/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:733056/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:73418/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:743100/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:749296/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:773025/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:784293/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:788630/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:825289/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:932124/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:950006/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1480882/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1044483/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1052751/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1108528/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1110984/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1128934/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1216347/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:12875/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1317673/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1323333/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1385395/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1437559/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1461842/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1041008/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1483324/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1495127/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1499417/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1512212/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1534412/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:154234/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1600976/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:179212/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:17982/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:213395/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:224312/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGGTGTTGTATTTCt  >  1:722315/1‑67 (MQ=255) ccACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCCGAGCAGTTTTTGTATTTCt  >  1:1514483/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CCACCGCCCGTAAAATGCGGGCGGGTTTAGAAAGGTTACCTTATGTCTGAGCAGTTTTTGTATTTCT  >  W3110S.gb/4043972‑4044038

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑