Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4072936	4072970	35	69 [0]	[0] 47	glgA	glycogen synthase

CAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCTTT  >  W3110S.gb/4072879‑4072935                                                         | cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:511006/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:729716/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:704573/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:574773/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:557607/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:549532/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:538240/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:536266/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:520775/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:733571/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:495126/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:479996/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:459148/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:455244/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:395139/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:380012/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:228301/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:904545/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:978224/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:967521/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:963004/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:961063/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:958424/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:953193/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:942856/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:910823/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1604013/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:903740/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:902326/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:896134/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:879131/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:864438/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:834470/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:797942/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1316363/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1051478/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1055884/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1059612/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1061696/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1062219/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1067445/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1101738/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1158818/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1187841/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1212071/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1223812/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:12384/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1251688/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:128043/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1019135/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1328247/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1592376/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1575692/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1570748/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1530807/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1523301/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1480602/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:147253/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1431154/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1424830/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:142430/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:141197/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1376753/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1319685/57‑1 (MQ=255) cAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACAACCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1088374/57‑1 (MQ=255)  aaGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1140524/56‑1 (MQ=255)  aaGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1290258/56‑1 (MQ=255)   aGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCttt  <  1:1406239/55‑1 (MQ=255)       aTGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTctttcttt  <  1:208161/51‑1 (MQ=255)                                                         | CAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCATTCTTT  >  W3110S.gb/4072879‑4072935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑