Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4083998	4084066	69	46 [0]	[0] 127	rtcA	RNA 3'‑terminal phosphate cyclase

AGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGCTGCTG  >  W3110S.gb/4083929‑4083997                                                                     | aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:479527/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:243618/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:268518/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1089092/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:312818/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:317866/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:391828/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:39964/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:399713/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:465241/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:477478/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:274439/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:522851/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:58987/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:74735/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:748290/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:818691/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:874679/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:916021/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:929115/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:952431/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:212301/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1105214/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1105853/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1110678/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1135083/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1202631/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1209986/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1259592/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:126322/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1273023/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:127720/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1537626/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1566625/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1586376/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1977/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctcctg  <  1:1455680/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGACGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1337456/69‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCACCGATAACCAGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:850629/69‑1 (MQ=255)  gcggcgGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:524931/68‑1 (MQ=255)  gcggcgGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:823403/68‑1 (MQ=255)  gcggcgGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:226513/68‑1 (MQ=255)  gcggcgGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGGGCTGGAGCCGctgctg  <  1:516835/68‑1 (MQ=255)     gcggcACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1301579/65‑1 (MQ=255)         cACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:507261/61‑1 (MQ=255)                              gccTGCTGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGctgctg  <  1:1324307/40‑1 (MQ=255)                                                                     | AGCGGCGGCACCGATAACCCGTCGGCGCCGCCTGCGGATTTTATCCGCCGGGTGCTGGAGCCGCTGCTG  >  W3110S.gb/4083929‑4083997

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑