Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4084369	4084929	561	37 [0]	[0] 91	[rtcA]–[malT]	[rtcA],[malT]

TTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGT  >  W3110S.gb/4084317‑4084368                                                    | ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:763192/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:390102/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:47085/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:504948/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:574289/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:599275/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:639093/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:663670/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:733369/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:759374/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:374202/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:764187/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:767229/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:828983/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:857027/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:868473/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:92520/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:928404/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:987651/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1464345/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:106654/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1074424/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1097003/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1197574/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1248676/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1368963/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1447577/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1057904/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1464920/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:147850/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1511244/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1514624/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:174741/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:300942/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:319365/1‑52 (MQ=255) ttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:331053/1‑52 (MQ=255) atGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGt  >  1:1276184/2‑52 (MQ=255)                                                    | TTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGT  >  W3110S.gb/4084317‑4084368

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑