Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4094347	4095003	657	65 [0]	[0] 156	[gntY]–[gntX]	[gntY],[gntX]

GGAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGT  >  W3110S.gb/4094281‑4094346                                                                  | ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGCTCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:95637/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCGCATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:498250/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGCCCATGGAACAACCGt  >  1:999760/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:704386/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:364117/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:695312/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:652211/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:616365/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:612776/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:605041/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:548980/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:524828/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:506015/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:475345/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:404833/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:374015/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:373839/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:34762/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:733538/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:752362/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:771779/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:773518/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:793697/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:798830/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:846665/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:853984/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:857778/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:860575/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:869226/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:925396/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:930093/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:935481/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:971132/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1406167/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1027684/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:103341/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1050876/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1056379/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:106052/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1062535/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1131259/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1135651/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:113876/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1153143/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1197672/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:120152/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1265620/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1355878/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1381355/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1016663/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1417136/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:142310/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:142509/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1433919/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1442719/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1459130/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1469589/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1561301/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:1573284/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:213548/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:224795/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:240892/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:257197/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:258741/1‑66 (MQ=255) ggAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGt  >  1:339977/1‑66 (MQ=255)                                                                  | GGAATTCGTTCAGCAGCTGCTTCTCGATCCCTTCTTTCAGCGTCACATCGACCATGGAACAACCGT  >  W3110S.gb/4094281‑4094346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑