Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4120415 4120464 50 89 [0] [0] 70 hofQ predicted fimbrial transporter

GGCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGTT  >  W3110S.gb/4120348‑4120414
                                                                  |
ggCGTTGTGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1137041/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACATCGCATGTCGGtt  <  1:222870/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:435676/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:622203/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:619290/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:618946/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:614707/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:612320/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:60553/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:599902/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:504725/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:481971/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:475562/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:471305/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:6255/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:401035/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:314504/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:274261/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:243664/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:210718/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:191332/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:178118/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:174767/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:789318/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:998347/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:986691/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:971372/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:947170/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:931132/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:91084/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:880009/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:833242/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:79604/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:792755/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:168415/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:786904/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:775261/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:708647/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:700607/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:650452/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:649111/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:629805/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:62840/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:625687/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:11753/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1008659/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1240622/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1240568/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1233176/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:122644/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1223846/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1221206/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1206912/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1198726/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1176247/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1298992/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1166128/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1159042/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1151368/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1114059/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1107016/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1049097/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1034269/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1033622/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1027931/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1465511/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:164518/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1588150/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1579669/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1552670/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1538338/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1536833/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1533519/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1524281/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1517771/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1449560/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1432255/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1345506/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1343198/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1338884/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1330942/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1321018/67‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1319089/67‑1 (MQ=255)
 gCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1434794/66‑1 (MQ=255)
 gCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:698293/66‑1 (MQ=255)
 gCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:1274644/66‑1 (MQ=255)
    ttGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:131215/63‑1 (MQ=255)
                    gCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGAGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:117431/47‑1 (MQ=255)
                            gCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGtt  <  1:343087/39‑1 (MQ=255)
                                                                  |
GGCGTTGGGCAAGTCACCACGCTTGGTAGCGACCTCTCCGTAGCGACGGCGACAACGCATGTCGGTT  >  W3110S.gb/4120348‑4120414

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: