Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4178330 4178360 31 55 [0] [0] 148 gspI general secretory pathway component, cryptic

Only 100 of 148 total aligned reads displayed.

GCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATCC  >  W3110S.gb/4178361‑4178428
|                                                                   
gCTCATTAAAGTCAGAGCCACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1522337/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATGGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1000280/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGTCTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1077388/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCTGTGTCATcc  <  1:40/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:56928/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:244732/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:554232/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:525383/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:508119/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:465365/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:454569/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:450680/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:444101/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:430252/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:423287/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:41911/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:411203/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:407891/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:404197/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:397921/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:36267/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:360859/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:338856/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:31314/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:295759/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:272298/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1001473/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:798368/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:993914/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:982082/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:921305/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:917744/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:884624/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:884052/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:870052/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:862848/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:851622/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:844244/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:811473/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:807502/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:574028/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:793287/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:786930/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:770354/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:756732/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:748750/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:7244/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:723929/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:696390/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:686803/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:614382/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:612113/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1151398/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1335104/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1309455/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1285179/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1262492/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1254446/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1238969/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:123744/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1235443/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1228332/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1187310/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:117651/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1348131/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1145658/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1112200/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1111440/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1095004/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1088532/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1085093/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1061460/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1056088/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1045297/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1039714/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1008301/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1360054/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:187170/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:177789/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:164911/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:164250/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1603878/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:157696/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1558973/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1556789/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1537160/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1519508/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1515513/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1512404/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1496406/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1494694/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1493531/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1436048/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1423289/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:141543/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1414678/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1373858/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:1372770/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATcc  <  1:200088/68‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGCGTCATcc  <  1:194145/68‑1 (MQ=255)
|                                                                   
GCTCATTAAAGTCAGAGCAACAGCGGTGAAAATACTCATCGCCAGTAAGACTTCAAGCAGTGTCATCC  >  W3110S.gb/4178361‑4178428

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑