Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4186662	4186667	6	111 [0]	[0] 24	pioO	part of gsp divergon involved in type II protein secretion

GTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATTTCTT  >  W3110S.gb/4186668‑4186735 |                                                                    gTAAAAGCCGATGTCACTGTAGAGGCTGTATCGCCCGCTTTTTAAGAATc                    >  1:713269/1‑50 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGcc                                   >  1:159439/1‑35 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:440007/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:999734/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:880838/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:845307/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:838919/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:805426/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:746031/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:741813/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:703462/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:692533/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:643/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:1039036/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:326026/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:317950/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:258399/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:21419/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:1604110/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:1594069/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:1375769/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:1254411/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATttctt  >  1:1129292/1‑68 (MQ=255) gTAAAAGCCCAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTAt       >  1:104823/1‑63 (MQ=255) |                                                                    GTAAAAGCCGAAGTCACTGTAGAGGCTGAAACGCCCGCTTTTAAACAATCAACACAACACTATTTCTT  >  W3110S.gb/4186668‑4186735

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑