Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4186927	4186976	50	63 [0]	[0] 62	pioO/rpsJ	part of gsp divergon involved in type II protein secretion/30S ribosomal subunit protein S10

GCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTC  >  W3110S.gb/4186977‑4187045 |                                                                     gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:664465/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1009764/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:293804/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:295311/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:309164/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:316498/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:376903/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:528679/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:531963/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:558428/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:588595/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:594099/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:600246/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:633632/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:649883/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:658240/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:285679/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:673661/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:689879/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:704654/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:717733/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:741005/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:771174/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:825021/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:845231/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:866724/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:896059/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:913124/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:957492/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:981271/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:999590/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1435253/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1025895/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1083918/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1127168/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1187823/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1205630/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1226411/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1264804/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:127896/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1294476/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1294780/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1299725/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1376089/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1381723/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1429644/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:285647/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1470950/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1475733/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1481512/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1503935/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1514564/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1540996/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:1574697/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:159844/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:191932/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:198637/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:256271/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:258083/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:25811/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:28323/69‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTAGATGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTc  <  1:755999/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GCTTGTCGTAGTTGACAGCAGGTTCAATCTGAACCTCAGTTAGCCGAATTTGGCTACCTAACAATGCTC  >  W3110S.gb/4186977‑4187045

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑