Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4235525	4235527	3	167 [0]	[0] 63	lysC	aspartokinase III

CCGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTCC  >  W3110S.gb/4235528‑4235596 |                                                                     ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATGACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1116591/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATATCAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:233894/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAAt               >  1:1573353/1‑56 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACgg      >  1:1089614/1‑65 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:451976/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:62224/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:621456/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:619082/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:576748/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:528221/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:516040/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:474900/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:68218/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:446076/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:399593/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:391233/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:38510/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:666629/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:341296/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:695214/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:69922/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:794848/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:804404/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:841338/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:851020/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:886843/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:906340/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:907424/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:932248/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:958121/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:987982/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:281553/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1036242/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1052774/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1055404/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1183631/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1206695/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1225855/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1253472/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1300331/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1300418/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1395285/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1429132/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1470503/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:15154/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1031896/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:277441/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:26394/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1591318/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1569158/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1559908/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:151122/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:149212/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1488121/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTc   >  1:796646/1‑68 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTc   >  1:645039/1‑68 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTc   >  1:1445728/1‑68 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTc   >  1:974180/1‑68 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCAGGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1472437/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCCCCATAACAAATCATGCGAATGTTGaa         >  1:1582989/1‑62 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATAGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTcc  >  1:1214142/1‑69 (MQ=255) ccGGGCACCAGGAAGCACAGGATATAGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGtt    >  1:66056/1‑67 (MQ=255) ccGGGCACAAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTc   >  1:745208/1‑68 (MQ=255) |                                                                     CCGGGCACCAGGAAGCACAGGTTATGGCTGGATGCGCCATAACAAATCATGCGAATGTTGAACGGTTCC  >  W3110S.gb/4235528‑4235596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑