Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4336981	4337151	171	85 [0]	[0] 16	basS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BasR

ACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGT  >  W3110S.gb/4337152‑4337199 |                                                aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:1087873/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:1206480/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:1285584/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:1481115/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:200016/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:294203/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:361371/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:406624/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:423531/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:474593/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:539222/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:756411/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:806370/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:975320/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCAGCAGCAGGGt  <  1:192181/48‑1 (MQ=255) aCGATGGGCGTTTTCTA‑CAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGt  <  1:1274615/47‑1 (MQ=39) |                                                ACGATGGGCGTTTTCTACCAGGTTTCGCAATAACATCCGCAGCAGGGT  >  W3110S.gb/4337152‑4337199

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑