Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4435086	4435090	5	130 [0]	[0] 42	cycA	D‑alanine/D‑serine/glycine transporter

GGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTG  >  W3110S.gb/4435091‑4435145 |                                                       ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGa                     >  1:570587/1‑36 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGc                  >  1:853695/1‑39 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCg                 >  1:1554467/1‑40 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCTTCATTCGCGCATTtg  >  1:1351845/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCTTTCGCGCATTtg  >  1:1157872/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:630360/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:425621/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:429550/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:47273/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:484689/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:507713/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:56166/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:568030/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:574692/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:624543/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:401908/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:653189/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:717352/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:765940/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:78766/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:808109/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:846793/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:935420/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1464526/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:107622/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1132255/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1273584/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1348451/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:13649/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1372553/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1388683/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1398071/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1452285/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:408592/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1473914/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:203266/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:241772/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:248592/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:274621/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:284306/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:329910/1‑55 (MQ=255) ggtggCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTtg  >  1:1051378/1‑55 (MQ=255) |                                                       GGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTG  >  W3110S.gb/4435091‑4435145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑