Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4443139	4443316	178	162 [0]	[0] 46	ytfI	hypothetical protein

CAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTATT  >  W3110S.gb/4443317‑4443385 |                                                                     cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:597800/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:310222/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:33627/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:346229/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:412776/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:433195/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:442435/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:45876/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:462463/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:528953/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:546039/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:571406/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:265330/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:608295/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:624808/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:627192/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:666287/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:66909/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:763469/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:794399/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:835054/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:892065/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:920612/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1379032/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1046665/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1047785/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1145249/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1171026/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1222448/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1244942/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:129590/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1308609/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1314642/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1319773/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1349872/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1025877/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1379781/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1380715/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:139367/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1525030/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1556318/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1588688/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:1599281/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:169588/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:173153/69‑1 (MQ=255) cAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTAtt  <  1:212533/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CAGAGACTTAATTCCCCTATCCCATAGATAACGATAGGGGAAAATTATTTTTGCAGAATTTATGTTATT  >  W3110S.gb/4443317‑4443385

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑