Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4444735	4444809	75	14 [0]	[0] 75	ytfL	predicted inner membrane protein

TCGTCAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACG  >  W3110S.gb/4444810‑4444856 |                                               tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGtt           >  1:530665/1‑38 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGt            >  1:49477/1‑37 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTtctc        >  1:149116/1‑41 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCtcatcagg  <  1:1127794/47‑3 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCAca  >  1:1012179/1‑46 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCAc   >  1:1577916/1‑46 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:418578/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:615025/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:564880/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:529732/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:463500/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:45835/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:451852/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:447019/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:621373/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:418042/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:405526/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:373760/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:311375/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:309530/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:306703/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:751786/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:99336/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:906861/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:882353/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:880789/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:86987/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:862767/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:837787/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:832708/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:816452/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:251114/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:733147/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:716843/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:695086/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:685257/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:680962/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:673458/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:665198/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:652721/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1177346/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1278537/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:12678/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1251895/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:124276/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1242297/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1214252/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1197557/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1196174/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1303399/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1170226/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1113549/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1087316/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1086975/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1057359/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1045075/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1035182/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1026531/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1505803/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:263724/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:230091/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:175954/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1606368/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1584533/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1538728/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1537602/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1531123/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:284258/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1482380/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  >  1:1433496/1‑47 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1360215/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1358525/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1345115/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACg  <  1:1343248/47‑1 (MQ=255) tcgtcAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATAACg  >  1:1388190/1‑47 (MQ=255) |                                               TCGTCAATTGGGGTGCCGCCGTCAATCAGCCATGAGTTCTCATCACG  >  W3110S.gb/4444810‑4444856

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑