Missing coverage evidence...
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GCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAG  >  W3110S.gb/4535431‑4535499 |                                                                     gCCGGGTGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1214845/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:709787/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:390810/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:401343/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:475265/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:490290/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:497943/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:501955/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:523232/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:614297/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:639600/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:376052/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:711413/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:733672/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:775564/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:798796/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:824323/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:841724/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:843897/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1494664/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1028790/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:109452/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1152395/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1168438/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1206427/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1326129/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:139738/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1435329/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:380569/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1503874/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1548963/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1550665/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:200924/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:239311/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:269264/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:300007/69‑1 (MQ=255) gCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAg  <  1:1003853/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GCCGGGAGCCACTTCTCGCTGCACCGGAATGTTGTGTTCAAGAGCCGTCTGTTCCAACATCCGTATCAG  >  W3110S.gb/4535431‑4535499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑