Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4542874	4543095	222	45 [0]	[0] 46	yjhT	conserved hypothetical protein

CCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGA  >  W3110S.gb/4543096‑4543145 |                                                  cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:684403/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:344408/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:370636/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:43145/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:43829/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:439067/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:510630/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:521766/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:537782/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:585944/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:59313/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:649650/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:33260/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:728766/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:748023/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:765970/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:822234/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:834711/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:87462/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:90210/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:922066/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:940042/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:942078/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1392996/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1025651/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1043949/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1130549/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1141912/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1145782/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1200320/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1237418/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1267761/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1307740/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1323432/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1024449/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:141131/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:141222/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1429759/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:144492/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1511595/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:1563494/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:180495/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:188406/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:201545/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGa  <  1:313082/50‑1 (MQ=255) cccAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACATGa  <  1:1181908/50‑1 (MQ=255) |                                                  CCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGA  >  W3110S.gb/4543096‑4543145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑