Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	403430	403479	50	90 [0]	[0] 47	yaiC	predicted diguanylate cyclase

CTCTGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATAAA  >  W3110S.gb/403480‑403535 |                                                        ctctGCTGTTTGGCTTGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:10828/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:422886/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:935706/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:445048/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:463081/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:511413/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:531166/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:567610/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:568281/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:571527/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:589330/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:598656/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:653359/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:656811/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:707356/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:755862/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:802140/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:849720/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:870528/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:875908/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:881847/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:922061/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1020370/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1337362/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1099737/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1141492/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1153025/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:117282/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1179007/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1187842/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1200933/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1284199/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1296684/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:404775/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1379974/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1396580/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1408847/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1408871/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:1447607/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:182396/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:280982/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:31823/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:342746/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:375148/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:396994/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACCGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:87692/56‑1 (MQ=255) ctctGCTGTTTGGCTGGGGCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATaaa  <  1:821814/56‑1 (MQ=255) |                                                        CTCTGCTGTTTGGCTGGGTCAGCTACCAGACGGCAACCAAACTGGCGGAACATAAA  >  W3110S.gb/403480‑403535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑