Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4615068	4617348	2281	94 [0]	[0] 77	[prfC]–[yjjU]	[prfC],osmY,ytjA,[yjjU]

CCACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGACTG  >  W3110S.gb/4617349‑4617415 |                                                                   ccACAAATCGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:80206/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACTCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1045816/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:589212/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1606529/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:573742/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:561743/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:554425/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:519345/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:451519/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:450669/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:396809/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:340423/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:339103/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:30426/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:258902/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:224934/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:216254/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:188978/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:176523/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:167066/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:982078/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:73662/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1008107/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:912410/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:901798/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:882308/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:877150/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:863396/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:742450/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:740329/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:589353/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:707311/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:700879/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:686949/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:670606/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:652201/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:641350/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:607631/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:599637/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1125360/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1601926/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1225558/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1209274/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1208251/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1207850/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1197592/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1164287/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1155529/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1129577/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1254862/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:112258/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:111754/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1113323/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1110154/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1055294/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1052672/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1051350/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1050991/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1415460/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1595234/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1562124/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1553419/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:153732/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1509939/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1476154/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1467566/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1444572/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1260742/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1391269/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1366848/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1361468/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1361062/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1327583/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1295337/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1288248/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGActg  <  1:1262995/67‑1 (MQ=255) ccACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTAACGATCTCGActg  <  1:977968/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CCACAAAACGCGAATTTTTCGATCCATTGCGCTTTGTCCGTGGAGGAAATCTTATCGATCTCGACTG  >  W3110S.gb/4617349‑4617415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑