Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	418572	418686	115	84 [0]	[0] 27	phoR/brnQ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/predicted branched chain amino acid transporter

ACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTATCATC  >  W3110S.gb/418687‑418755 |                                                                     aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1021757/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:866412/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:82928/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:7387/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:674526/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:66836/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:398372/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:329604/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:281346/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:193191/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:188390/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:185128/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:136738/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1365105/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:127593/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1215499/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1204592/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1157732/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1092500/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1088910/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1088292/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1081071/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1064716/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1050841/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1023666/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcatc  <  1:1016220/69‑1 (MQ=255) aCTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTatcacc  <  1:900584/69‑3 (MQ=255) |                                                                     ACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTTTAAATATACCGCTGTATCATC  >  W3110S.gb/418687‑418755

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑