Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	481748	481895	148	118 [0]	[0] 76	acrB	multidrug efflux system protein

GCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACA  >  W3110S.gb/481896‑481964 |                                                                     gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:593137/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:780329/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:764927/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:764231/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:763984/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:763340/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:74698/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:730539/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:701888/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:653344/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:785653/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:586184/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:547610/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:537672/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:536106/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:532417/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:503867/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:46245/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:447874/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:885934/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:988453/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:986274/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:983084/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:921189/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:902045/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:901358/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:893572/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:888049/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:886072/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:439197/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:885379/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:878086/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:872867/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:871775/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:837703/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:819657/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:802515/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:791526/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1180209/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1314720/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:131384/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1313034/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1277792/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1261688/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1230896/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1226892/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1222092/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1192951/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1350499/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1161097/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1145674/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1086835/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1083308/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1072293/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1055237/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1047650/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1042848/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1599795/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:434490/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:434407/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:426798/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:368785/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:300182/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:228058/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:215619/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:203051/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1009484/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1554562/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1543476/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1542531/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1480876/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:145814/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1404413/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1366546/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:1358745/69‑1 (MQ=255) gCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGGCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACa  <  1:351498/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GCTGAACCATGGTCATAAACACGCCCTGGTCCTCATCTGGCAAGAAGGAGCTTGGCAGACGCACGAACA  >  W3110S.gb/481896‑481964

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑