Missing coverage evidence...
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TACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTG  >  W3110S.gb/498837‑498904 |                                                                    tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:668889/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:298735/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:318608/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:424549/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:435836/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:525388/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:545793/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:55312/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:570409/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:573584/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:603160/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:249688/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:709261/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:744801/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:765362/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:794167/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:799168/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:808500/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:838234/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:853580/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:866065/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:89168/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1400647/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1092017/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1128071/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1175255/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:118768/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:119123/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1197147/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:120094/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1233197/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1304610/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1352841/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1031039/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1407078/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1476619/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1550219/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1570460/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1582781/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:1593950/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:223595/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:225727/68‑1 (MQ=255) tACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTg  <  1:227348/68‑1 (MQ=255) |                                                                    TACCAATCACCGTACATTGGCTGTAGCTTGCCAGCAGGCGCATGATGCGATCGTGGGTATCGAGATTG  >  W3110S.gb/498837‑498904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑