Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 548378 | 548529 | 152 | 262 [0] | [0] 55 | ylbE ylbE |
ECK0512:JW0508+JW0507:b4572; hypothetical protein ECK0512:JW0508:b0519; hypothetical protein, C‑ter fragment |
AGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAT > W3110S.gb/548530‑548588 | aGCGCGTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:967026/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATgg > 1:1546622/1‑41 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGt > 1:67022/1‑57 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:437007/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:420183/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:449725/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:476385/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:477167/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:4976/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:548993/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:552424/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:560132/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:588469/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:620041/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:628454/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:636579/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:662616/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:689615/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:710572/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:726227/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:763383/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:765354/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:782450/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:786604/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:889450/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:912315/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:969260/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:971610/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:168738/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1242042/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1272968/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1273645/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1299048/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1363774/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1397957/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1411465/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1440053/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1445122/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1475817/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1574327/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1582299/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1593304/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:421929/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:190429/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:201696/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:22199/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:237326/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:275454/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:278812/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:321424/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:329629/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:359116/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:385511/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:391300/1‑59 (MQ=255) aGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAt > 1:1220475/1‑59 (MQ=255) | AGCGCCTGGCGTAACGCGCTTTGTCGGTGCGGGTGGCATGGAAGCGGCAAGAGCGGTAT > W3110S.gb/548530‑548588 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |