Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	583612	583861	250	228 [0]	[0] 46	[appY]	[appY]

CCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGT  >  W3110S.gb/583862‑583929 |                                                                    ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:3910/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1570739/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1591378/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:196533/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:219470/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:221956/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:231638/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:279919/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:285837/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:295647/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:305231/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:325945/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1561026/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:46871/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:48281/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:485787/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:493616/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:567265/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:695704/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:779607/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:807035/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:816860/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:929352/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:135609/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1053042/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1152038/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1179135/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1180614/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1198980/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1214614/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1260442/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1268232/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1272071/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:127647/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1277537/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1038601/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1358805/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1389255/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1392286/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1402379/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1417434/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:143724/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1462491/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1529784/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:1537134/68‑1 (MQ=255) ccGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagt  <  1:154841/68‑1 (MQ=255) |                                                                    CCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGT  >  W3110S.gb/583862‑583929

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑