Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	627161	627313	153	14 [0]	[0] 64	entB	isochorismatase

CGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTA  >  W3110S.gb/627314‑627369 |                                                        cGCTGGAGCTAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1409282/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACGGGGGta  <  1:1560/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGTGta  <  1:1354303/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:540987/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:654938/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:632438/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:58888/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:565591/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:547672/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:660169/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:497371/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:476496/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:47530/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:44082/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:420236/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:409004/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:382196/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:364359/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:328563/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:67794/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:717981/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:73530/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:768766/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:835733/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:856233/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:862945/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:897619/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:914396/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:959987/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:961867/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:963965/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:968162/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:981635/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:999745/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1386931/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1074426/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1080437/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1100014/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1138595/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1178236/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1184180/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1216488/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1261015/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:127665/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1285537/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1286688/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1294306/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1311956/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1359269/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:343072/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1392771/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:150268/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1505611/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1547039/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1571638/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:165959/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:180603/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:186372/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:188211/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:190043/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:19156/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:237456/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:312418/56‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGta  <  1:1004299/56‑1 (MQ=255) |                                                        CGCTGGAGCAAATGCTGAAAGAGAGTGGACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTA  >  W3110S.gb/627314‑627369

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑