Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	657744	658333	590	233 [0]	[0] 65	[cspE]–[crcB]	[cspE],[crcB]

AAAAACTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATG  >  W3110S.gb/658334‑658388 |                                                       aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTTTTTGATTTGTATg  <  1:199342/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTAtt  <  1:1098970/55‑2 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:540931/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:655857/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:65506/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:646618/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:643511/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:580631/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:573245/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:566522/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:565806/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:65914/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:522492/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:500164/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:499001/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:441781/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:424534/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:3298/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:268042/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:672295/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:711495/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:732706/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:745789/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:754125/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:762428/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:771448/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:788832/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:806230/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:841447/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:856571/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:906955/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:968618/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:98241/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:995420/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1331570/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1020136/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1040227/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1065922/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:108722/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1102614/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1124213/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1128977/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1212902/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1227855/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1231132/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1231317/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1237591/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1247399/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1269843/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1330180/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:297122/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1331956/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1343795/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1363469/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1405319/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1493285/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1534604/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1536792/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1552241/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1584972/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:169875/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:183720/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:192091/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATg  <  1:1017574/55‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTAATTGATTTGTATg  <  1:238450/55‑1 (MQ=255) |                                                       AAAAACTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATG  >  W3110S.gb/658334‑658388

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑