Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	884661	885300	640	35 [0]	[0] 40	cmr	multidrug efflux system protein

CAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCG  >  W3110S.gb/885301‑885351 |                                                   cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAATAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:815372/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGc                  >  1:835138/1‑35 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTg           >  1:895614/1‑42 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:583812/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:272467/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:312835/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:346289/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:387258/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:436176/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:446224/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:449309/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:466685/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:47287/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:26077/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:596356/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:626363/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:776790/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:858437/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:915109/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:996701/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:253877/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1042816/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1093018/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1133223/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1162293/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1218798/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1253615/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1283940/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1289593/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1338814/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1429305/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1466228/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1493671/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1550616/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1595962/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1602681/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:190891/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1000164/1‑51 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg  >  1:1386406/1‑50 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGCGTAAAAAAATGCCTGACTGCt         >  1:1405855/1‑44 (MQ=255) |                                                   CAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCG  >  W3110S.gb/885301‑885351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑